180-Watabe-Biosensoractivity

Project

Title
Imges of different biosensors activity expressed in HeLa cells, MDCK cells or mice ear skin.
Description
License
CC BY
Released at
March 31, 2022, midnight
Updated at
Funding
# of image datasets
115

Papers

Papers
Paper information: Tetsuya Watabe, Kenta Terai, Kenta Sumiyama, Michiyuki Matsuda (2020) Booster, a Red-Shifted Genetically Encoded Forster Resonance Energy Transfer (FRET) Biosensor Compatible with Cyan Fluorescent Protein/Yellow Fluorescent Protein-Based FRET Biosensors and Blue Light-Responsive Optogenetic Tools., ACS sensors, Volume 5, Number 3, pp. 719-730,
Pubmed ID: 32101394,
DOI: https://doi.org/10.1021/acssensors.9b01941,

Contacts

Contacts
Kenta Terai (Contact) , Department of Pathology and Biology of Diseases , Graduate School of Medicine

Biosamples

Organisms
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
Canis lupus familiaris (NCBI:txid9615)
Mus musculus (NCBI:txid10090)
Strains
NA
Cells
Cell lines

HeLa cell (CLO_0003684)
MDCK cell (CLO_0007646)

Anatomical information

UBERON
Anatomical entities

Gene ontology

GO: Biological processes
GO: Cellular components
GO: Molecular functions

Molecular biological information

Gene names
Protein names
Genetic methods
Protein tags
Probes
Oligo Primer
Genotype

Reagent or Compound

Reagent or Compound
Concentration
Fold Dilution

Imaging information

Dimensions
X scales
1.242 micrometer/pixel, 0.621 micrometer/pixel, 0.0176398 centimetre/pixel, 0.31 micrometer/pixel, NA, 0.994 micrometer/pixel,
Y scales
1.242 micrometer/pixel, 0.621 micrometer/pixel, 0.0176398 centimetre/pixel, 0.31 micrometer/pixel, NA, 0.994 micrometer/pixel,
Z scales
3 micrometer/slice, 1 micrometer/slice, 6 micrometer/slice, NA,
T scales
57 sec per time interval, 58 sec per time interval, 1 sec per time interval, 60.47 sec per time interval, 62 sec per time interval, 59 sec per time interval, 1 min per time interval, 60 sec per time interval, 120 sec per time interval, 122 sec per time interval, NA, 124 sec per time interval, 125 sec per time interval, 142 sec per time interval,
Channels
,

Biological Imaging Methods Ontology

Microscopy types
Detection methods
Visualization methods
Illumination methods
Sources of contrast
Contrast enhancing methods
Resolution enhancing methods
Imaged parameters
Sample preparation methods

Instruments

Datasets

Dataset name
Organism
Gene / Protein
Dimensions
File size
SSBD:OMERO
Download
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74986
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
75199
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74986
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74971
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74986
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74968
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74986
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74971
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74990
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74973
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74986
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74971
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
75214
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74971
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74986
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74971
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74986
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74971
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74987
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74971
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74987
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74972
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74985
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74972
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74987
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74972
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74987
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74972
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74987
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74972
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74987
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
74974
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
52186
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
47788
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
52388
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
47782
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
48475200
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
47958
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
51470
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
1095172
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
1095018
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
1094830
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
1095580
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
197852212
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
197852418
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
197852398
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
197854298
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
197853546
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
813560
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
813436
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
813296
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
817952
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
147335180
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
147335330
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
147335314
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
147336740
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
147336170
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
2093600
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
2093738
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
2093742
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
2094852
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
2094882
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
2094884
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
378862748
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
378862558
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
378862212
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
378866676
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
378866492
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
378866138
zip
Canis lupus familiaris (NCBI:txid9615)
33684918
zip
Canis lupus familiaris (NCBI:txid9615)
33684230
zip
Mus musculus (NCBI:txid10090)
66412
zip
Mus musculus (NCBI:txid10090)
66742
zip
Mus musculus (NCBI:txid10090)
66472
zip
Mus musculus (NCBI:txid10090)
66472
zip
Mus musculus (NCBI:txid10090)
64296
zip
Mus musculus (NCBI:txid10090)
64410
zip
Mus musculus (NCBI:txid10090)
64420
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475647
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479906
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475647
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479907
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475646
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479904
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475647
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479907
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475647
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479915
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475647
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479907
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475647
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479907
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475647
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479907
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475647
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479907
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475647
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479907
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475647
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479907
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475646
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
509503
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475647
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479907
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475647
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479907
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475646
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479904
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
475646
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
479904
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
52674
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
51986
zip
Homo sapiens (NCBI:txid9606)
51948
zip