20240216_spPKA-KTR1.0_Yeast_revision

・Hta1-mNGのnuclear areaの定量
data: 20231017-PKAKTR-SK186 (mNG)
outpotのtrackedでcell idを確認。cell id=1を対象とした。
Hta1-mNG画像とtarcked画像から40x40で切り抜き（0,120,121,126 frame）
scale bar; 5 um

・cytoplasmic intensityの定量
data: 20231017-PKAKTR-SK186
Cytoの最初の値でノーマライズ, fig4Bと同じデータについてcytoplasmic intensityを示す
細胞質の輝度が下がっていそうなのでだめ。細胞全体の輝度を測る。
cell poseを使ってみる。
n=12 cells
Excelの黄色でハイライトしたデータを使用した。
20min毎に定量して、0–160 minまでの9タイムポイントを定量した。

・N飢餓時のPKAKTRの定量
Data: 20201217-PKAKTR-mating/PKAKTR-mating-1.nd
interval 5min, 49 frameまで (totalは241だけど49までを使用)
YEA for 2hr 1psi -> EMM-N+C 15sec 8psi -> EMM-N+C 2hr 1psi
rolling ballでバックを引く
ONIXの観察領域だけを切り抜き 561x561
cellTKで解析
pythonで解析